اما در این بین موضوع شهریه برای دانشجویانی که در دوره های نوبت دوم یا شبانه قصد ادامه تحصیل دارند، می تواند مهم باشد، که در ادامه شهریه نوبت دوم 10 دانشگاه بزرگ تهران در این مقطع آمده است:
** شهریه دوره شبانه دکتری ۹۸ دانشگاه تربیت مدرس
برای رشته گرایش های دانشکده های علوم انسانی، مدیریت و اقتصاد و حقوق هزینه تحصیلی مبلغ ۷۵۸,۶۶۰,۰۰۰ (هفتصد و پنجاه و هشت میلیون و ششصد و شصت هزار) ریال می باشد و در سایر رشته گرایش ها (دانشکده های علوم پایه، علوم ریاضی، علوم زیستی، فنی و مهندسی، مهندسی برق و کامپیوتر، مهندسی شیمی، مهندسی عمران و محیط زیست، مهندسی صنایع، مهندسی مکانیک، کشاورزی، منابع طبیعی و علوم دریایی، هنر و معماری هزینه تحصیلی مبلغ ۹۲۷,۲۵۰,۰۰۰ (نهصد و بیست و هفت میلیون و دویست و پنجاه هزار) ریال می باشد.(جزئیات بیشتر)
** شهریه دکتری ۹۸ دانشگاه علامه طباطبایی
** شهریه دوره شبانه دکتری ۹۸ دانشگاه تهران
** شهریه دوره شبانه دکتری ۹۸ دانشگاه امیرکبیر
شهریه سال 99-98به شرح ذیل می باشد:
شهریه ثابت به ازای هر نیمسال:61.600.000 ریال
شهریه متغیر به ازای هر واحد (درس و پروژه): 10.450.000 ریال
شهریه امتحان جامع: 26.400.000 ریال
شهریه تصویب پروپوزال: 26.400.000 ریال
** شهریه دوره شبانه دکتری ۹۸ دانشگاه شهید بهشتی
** شهریه دوره شبانه دکتری ۹۸ دانشگاه شریف
** شهریه دوره شبانه دکتری ۹۸ دانشگاه خواجه نصیر
** شهریه دوره شبانه دکتری ۹۸ دانشگاه خوارزمی
** شهریه دوره شبانه دکتری ۹۸ دانشگاه شاهد
** شهریه دوره شبانه دکتری ۹۸ دانشگاه مالک اشتر