از سوی دیگر قابلیت قفل با اثر انگشت نیز که قبلا تنها در نسخه آی او اس واتس اپ در دسترس بود به گوشی های اندرویدی نیز اضافه شده است. با فعال کردن قابلیت یادشده دسترسی به برنامه واتس اپ تنها از طریق وارد کردن اثر انگشت امکان پذیر است.
کاربران اندروید برای فعال کردن قفل اثر انگشت واتس اپ باید بر روی آیکون تنظیمات کلیک کنند و سپس گزینه حساب کاربری و سپس حریم شخصی و در نهایت بازکردن قفل با اثر انگشت را انتخاب کنند. این قابلیت را می توان به گونه ای تنظیم کرد که بعد از گذشت مدت زمان خاصی فعال شود یا هر بار در زمان بازشدن برنامه وارد کردن اثر انگشت ضروری باشد.
البته کاربران نسخه آی او اس واتس اپ می توانند قابلیت فیس آی دی با باز کردن قفل برنامه با چهره شان را نیز فعال کنند، ولی این خدمات برای نسخه اندروید واتس اپ در دسترس نیست.
